Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMC3Q9UQE7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMC3Q9UQE7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms