Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK1Q9UPV9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAK1Q9UPV9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms