Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SS18L2Q9UHA2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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SS18L2Q9UHA2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SS18L2Q9UHA2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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