Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NLKQ9UBE8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NLKQ9UBE8 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms