Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ZNRD1Q9P1U0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms