Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCNT4Q9P109 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCNT4Q9P109 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms