Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRMT1Q9NXH9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRMT1Q9NXH9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms