Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATAD3AQ9NVI7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATAD3AQ9NVI7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms