Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms