Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD1Q9NUN5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms