Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOMER2Q9NSB8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOMER2Q9NSB8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms