Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TLR9Q9NR96 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms