Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCNB1IP1Q9NPC3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms