Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SDCBP2Q9H190 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms