Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PHACTR1Q9C0D0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHACTR1Q9C0D0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms