Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM7Q9C029 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms