Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
YTHDF1Q9BYJ9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms