Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RNF17Q9BXT8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
RNF17Q9BXT8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms