Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PRADC1Q9BSG0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms