Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00467Q9BRT7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00467Q9BRT7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms