Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ15

NABP2, SOSS complex subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP2Q9BQ15 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NABP2Q9BQ15 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NABP2Q9BQ15 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms