Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RUFY1Q96T51 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RUFY1Q96T51 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms