Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NEDD4LQ96PU5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NEDD4LQ96PU5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms