Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC7Q96M83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC7Q96M83 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms