Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RMDN2Q96LZ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RMDN2Q96LZ7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms