Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZNF479Q96JC4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF479Q96JC4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms