Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CPNE2Q96FN4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CPNE2Q96FN4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms