Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MFSD3Q96ES6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MFSD3Q96ES6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MFSD3Q96ES6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms