Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AP3S1Q92572 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S1Q92572 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms