Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
COLGALT1Q8NBJ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLGALT1Q8NBJ5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms