Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD53Q8N9V6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD53Q8N9V6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms