Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZIC4Q8N9L1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZIC4Q8N9L1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms