Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM50Q86XT4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM50Q86XT4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms