Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFXL1Q6ZNB6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFXL1Q6ZNB6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms