Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC171Q6TFL3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC171Q6TFL3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms