Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL35Q6PF15 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL35Q6PF15 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms