Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E4F1Q66K89 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E4F1Q66K89 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms