Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZFYVE27Q5T4F4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZFYVE27Q5T4F4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms