Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATAD3CQ5T2N8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms