Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL39P5Q59GN2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms