Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKDCCQ504Y2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PKDCCQ504Y2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms