Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGCBQ16585 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms