Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNCBQ16143 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SNCBQ16143 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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