Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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TWIST1Q15672 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
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TWIST1Q15672 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TWIST1Q15672 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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TWIST1Q15672 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TWIST1Q15672 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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TWIST1Q15672 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TWIST1Q15672 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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