Protein–RNA interactions for Protein: Q14739

LBR, Lamin-B receptor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBRQ14739 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LBRQ14739 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LBRQ14739 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LBRQ14739 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms