Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COL9A3Q14050 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COL9A3Q14050 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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