Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CAPSQ13938 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CAPSQ13938 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
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