Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRF5Q13568 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IRF5Q13568 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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