Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MSLNQ13421 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MSLNQ13421 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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