Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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PDZK1IP1Q13113 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDZK1IP1Q13113 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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